在形态学、生理学、分类学、昆虫学、古生物学等领域均有重要成就。他生前发表学术论文65篇，将其初步分类，计在脊椎动物形态学和生理学方面有28篇，其中神经解剖及神经生理学约占半数，昆虫学及昆虫生理学7篇，腹足类软体动物分类学11篇，动物区系6篇，古生物学11篇，考古学1篇。由此可见，秉志最擅长形态学和生理学，尤其精于神经解剖和神经生理学。在昆虫学、古生物学和腹足类分类学的研究方面也很有声望。
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